在組織或細(xì)胞培養(yǎng)過(guò)程的許多步驟中都使用水。它是緩沖液和介質(zhì)的主要成分，用于溶解添加劑和藥物，以及沖洗生物反應(yīng)器，塑料制品和玻璃制品。因此，水質(zhì)可能在細(xì)胞培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)結(jié)果中起重要作用。

細(xì)菌，酵母或霉菌對(duì)細(xì)胞培養(yǎng)物的污染一直是一個(gè)令人擔(dān)憂的問(wèn)題，科學(xué)家竭盡全力避免它們。這些污染通常是肉眼或通過(guò)光學(xué)顯微鏡可見(jiàn)的。但是，化學(xué)物質(zhì)的污染也可能影響培養(yǎng)細(xì)胞的生長(zhǎng)，形態(tài)或行為，但肉眼無(wú)法察覺(jué)。

水中天然存在的一些化合物會(huì)影響細(xì)胞培養(yǎng)：

細(xì)菌和內(nèi)毒素
細(xì)菌污染會(huì)導(dǎo)致培養(yǎng)基pH值突然變化并污染純培養(yǎng)物。此外，大多數(shù)革蘭氏陰性細(xì)菌會(huì)釋放內(nèi)毒素，這是一種復(fù)雜的脂多糖（LPS）。巨噬細(xì)胞和單核吞噬細(xì)胞響應(yīng)內(nèi)毒素刺激釋放多種促炎細(xì)胞因子。內(nèi)毒素也會(huì)影響其他類(lèi)型的細(xì)胞，甚至缺乏CD14內(nèi)毒素受體的細(xì)胞。影響包括細(xì)胞生長(zhǎng)和功能的變化，克隆效率以及重組蛋白的產(chǎn)生。

無(wú)機(jī)離子
汞，鉛，鋅，鎳，鉻和鎘等重金屬已被證明對(duì)各種細(xì)胞（包括神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞和神經(jīng)細(xì)胞）有毒。鎂抑制6-磷酸葡萄糖脫氫酶和DNA核酸酶II。錳導(dǎo)致DNA聚合酶將核糖而非脫氧核糖摻入新生的DNA鏈中。

有機(jī)化合物
小有機(jī)分子通常存在于原水供應(yīng)中（腐殖酸，單寧酸，農(nóng)藥，內(nèi)分泌干擾物等），并可能殘留在自來(lái)水中。已知這些物質(zhì)會(huì)影響細(xì)胞的發(fā)育，因此應(yīng)在實(shí)驗(yàn)室級(jí)水的生產(chǎn)過(guò)程中通過(guò)適當(dāng)?shù)姆椒▽⑵涑ァ?nbsp;

此外，水還用于許多與細(xì)胞培養(yǎng)有關(guān)的儀器中，例如高壓滅菌器和培養(yǎng)箱。