厭氧菌是對氧氣敏感的一類細菌，在有氧氣的環境中不能 生存或生存極差，而且多數厭氧菌是機體內正常菌群的一部
分。因此懷疑厭氧菌感染時標本的采集需要特別注意：①應盡量避免接觸空氣；②不被正常菌群污染。
采集厭氧菌培養標本原則上應從無正常菌群寄居的部位采取，對穿刺點進行消毒后，無菌操作抽取血液、關節液、心包液、腹、胸腔積液和膀胱穿刺液等標本；封閉性膿腫用注射器抽取；可通過纖維支氣管鏡保護性毛刷或支氣管肺泡灌洗從支氣管、肺中獲取呼吸道分泌物或經支氣管肺活檢獲取肺活組織；子宮腔分泌物采用雙套管官腔鏡采取。
采集的標本應立即排空注射器內的空氣（應在針頭上包裹酒精棉球），立即將注射器針頭插入無菌橡皮塞中以隔jue空氣，運送**實驗室；**好將標本立即注入密封的無氧小瓶中，瓶中裝有0. 5ml厭氧培養基，并含有氧氣指示劑刃天青，無氧氣時不顯色，小瓶內液體呈現淡黃色或無色。小瓶內液體顯示粉紅色表示有氧氣，不能使用。也可在床邊直接接種**預還原的培養基中，放人厭氧袋，打開氣體發生裝置，密封后運送**實驗室。
以下標本不宜做厭氧菌培養：鼻咽拭子、咳出的痰液及氣管抽取物、胃和腸道內容物、肛拭子、自行排出及導出的尿液、陰道及子宮拭子、前列腺分泌物、褥瘡潰瘍及粘膜層表面拭子、皮膚和粘膜拭子等。
